Ngày 08 và 22/12/2023, Chủ tịch UBND tỉnh Quảng Ngãi ban hành 2 thông báo kết luận về đơn tố cáo đối với ông Thành. Cụ thể, ông Thành tham mưu với Chủ tịch UBND tỉnh giao cho Viện trưởng Viện di truyền nông nghiệp làm chủ nhiệm đề tài (cấp tỉnh) KH&CN: "Tuyển chọn, nhân nhanh một số giống sắn mới kháng bệnh khảm lá, năng suất cao phục vụ canh tác sắn bền vững tại Quảng Ngãi".
Việc triển khai sản xuất 2 giống sắn HN3 và HN5 được thực hiện tại các huyện: Sơn Hà, Sơn Tịnh năm 2022 với 2,3ha; Sơn Hà, Sơn Tịnh và Nghĩa Hành năm 2023 với 15ha khi chưa được phép lưu hành tại tỉnh, không thực hiện đầy đủ trách nhiệm kiểm tra nhiệm vụ KH&CN. Khoảng 1ha tại xã Sơn Trung (H.Sơn Hà) không nằm trong phạm vi nhiệm vụ KH&CN, mà bản chất là hành vi "khảo nghiệm giống cây trồng". Việc ông Thành báo cáo UBND tỉnh 1ha này thuộc đề tài là trái quy định.
Tiếp đến, ông Thành tham mưu UBND tỉnh giao cho Công ty TNHH KH&CN Nông Tín thực hiện đề tài KH&CN: "Thực nghiệm mô hình trồng, chế biến và tiêu thụ sản phẩm Sacha inchi tại huyện Ba Tơ và Trà Bồng", khi giống Sacha inchi chưa được phép lưu hành tại tỉnh.
Cũng đề tài này, GS.TS Trần Đăng Hòa (trường ĐH Nông lâm Huế) đề xuất và đạt 7/8 phiếu đề nghị thực hiện; Công ty Nông Tín chỉ có 1/8 phiếu đề nghị. Tuy nhiên, Sở KH&CN chọn Công ty Nông Tín. Dự án (DA) trồng thực nghiệm cây Sachi ở H.Ba Tơ trên hơn 11,6ha, với 14 hộ và một tổ chức tham gia, vốn hơn 2,3 tỷ đồng. Kết quả, cây trồng chết héo, người dân gánh nợ. UBND huyện Ba Tơ xác nhận: DA không đem lại hiệu quả kinh tế cho người dân. Ông Thành tham mưu UBND tỉnh ban hành các quyết định (QĐ) tuyển chọn, giao nhiệm vụ KH&CN cấp tỉnh cho 9 cơ quan trái quy định.
Giám đốc Sở KH&CN tham mưu Chủ tịch UBND tỉnh phê duyệt QĐ triển khai thực hiện 6 DA, nhiệm vụ KH&CN thì có 3/6 DA, nhiệm vụ KHCN trùng lặp về nội dung. Cụ thể, DA hỗ trợ ứng dụng tiến bộ kỹ thuật phát triển chăn nuôi bò lai ở H.Đức Phổ trùng lặp 5 nội dung với DA xây dựng mô hình phát triển chăn nuôi bò thành nghề sản xuất chính của nông hộ ở H.Đức Phổ.
Ông Thành chưa tham mưu UBND tỉnh ra QĐ giao quyền sử dụng tài sản của 35 nhiệm vụ KH&CN; chưa kiểm tra, giám sát, yêu cầu tổ chức được giao quyền sử dụng tài sản, báo cáo hiệu quả ứng dụng các nhiệm vụ KH&CN. Những sai phạm này gây tốn kém, lãng phí ngân sách cấp cho hoạt động KH&CN. Ngoài ra, ông Thành còn lập một số nội dung đề tài, DA, nhiệm vụ KH&CN, nghiệm thu kết quả thực hiện nhiệm vụ KH&CN; lập dự toán và thanh quyết toán; đánh giá hiệu quả 9 nhiệm vụ KH&CN vi phạm quy định Nhà nước.
Bên cạnh đó, ông Thành tham mưu UBND tỉnh ra QĐ đầu tư, mua sắm, trang thiết bị cho Phòng thí nghiệm công nghệ sinh học (Sở KH&CN làm chủ đầu tư, vốn hơn 7 tỷ đồng) nhưng không sử dụng. DA hoàn thành tháng 01/2021, đến nay thì "đắp chiếu". Năm 2018, dù chưa xây dựng Phòng nhưng Sở mua sắm trang thiết bị hơn 2,1 tỷ đồng.
Việc mua sắm trang thiết bị không đồng bộ, tài sản mua ở giai đoạn 1 (năm 2018) khi Phòng chưa được đầu tư. Ở giai đoạn 2, các thiết bị chưa được sử dụng. Còn 8 nội dung tố cáo khác, Thanh tra tỉnh đã xác minh, chưa có kết luận. Một số nội dung tố cáo ông Thành vi phạm pháp luật khác được Chủ tịch UBND tỉnh kết luận là không có cơ sở, đúng một phần...
Tháng 12/2022, Cơ quan CSĐT Công an tỉnh Quảng Ngãi nhận được đơn tố giác tội phạm đối với ông Thành về sai phạm trong quản lý nhà nước đối với việc thực hiện các nhiệm vụ KH&CN, mua sắm trang thiết bị máy móc cho Trung tâm Ứng dụng KH&CN. Tháng 5/2023, trong thông báo của Công an tỉnh có nội dung: Trong quá trình tham gia đấu thầu, Công ty TNHH Sản xuất TMDV Hoàng Vinh do ông Nguyễn Trung Vinh làm Giám đốc thông thầu với các đơn vị tham gia dự thầu, đơn vị báo giá và gian lận trong việc lập hồ sơ dự thầu, nhằm trúng thầu. Hành vi của ông Vinh và các cá nhân có dấu hiệu của tội phạm.
Ngày 30/11/2023, Hội đồng định giá tài sản cấp tỉnh trong tố tụng hình sự có kết luận về tài sản Nhà nước vào năm 2018 là hơn 1,9 tỷ đồng. Ngày 14/12/2023, Cơ quan CSĐT có thông báo về việc ra QĐ phục hồi điều tra nguồn tin tố giác tội phạm đối với ông Thành.
Để có những kết luận về sai phạm của ông Thành, công lớn của người tố cáo là TS. Phan Văn Hiếu - Phó Giám đốc Sở KH&CN. Trước đó, ông Hiếu giữ các chức vụ Phó Chủ tịch Liên minh HTX tỉnh, Phó Bí thư Huyện ủy Nghĩa Hành, Phó Chủ tịch Liên hiệp các Hội KH&KT tỉnh... Ở nhiều vị trí công tác, ông Hiếu nhiều lần báo cáo, tố cáo những vấn đề sai phạm, tiêu cực của đơn vị, lãnh đạo, cán bộ đơn vị.
Trong các thông báo kết luận, Chủ tịch UBND tỉnh Quảng Ngãi yêu cầu ông Thành kiểm điểm trách nhiệm; giao Sở KH&CN kiểm tra, rà soát các nhiệm vụ KH&CN có vi phạm, tham mưu UBND tỉnh xử lý; giao Giám đốc Sở Nội vụ chủ trì, phối hợp với Sở KH&CN xác định từng thành viên tham gia các Hội đồng KH&CN để kiểm điểm trách nhiệm hoặc kiến nghị cơ quan có thẩm quyền kiểm điểm trách nhiệm...