Theo dự kiến, phiên tòa kéo dài 5 ngày, thẩm phán Nguyễn Xuân Văn ngồi ghế chủ tọa. 19 luật sư đăng ký bào chữa; bị cáo Nguyễn Quang Tuấn, cựu Giám đốc BV Tim Hà Nội, có 2 luật sư.
Trong vụ án này, 12 bị cáo cùng bị truy tố tội vi phạm quy định về đấu thầu gây hậu quả nghiêm trọng. Trong đó, bị cáo Tuấn bị khởi tố khi đang là Giám đốc BV Bạch Mai, để xử lý sai phạm thời làm Giám đốc BV Tim Hà Nội. Các bị cáo khác gồm: Hoàng Thị Ngọc Hưởng, cựu Phó giám đốc BV Tim Hà Nội; Nguyễn Thị Dung Hạnh, cựu Kế toán trưởng, Trưởng phòng Tài chính kế toán BV Tim Hà Nội; Nguyễn Đức Đảng, Chủ tịch HĐQT Công ty CP thiết bị y tế Hoàng Nga (Công ty Hoàng Nga); Phan Tuấn Đạt, cựu Chủ tịch HĐQT, Phó giám đốc Công ty CP công nghệ sinh học Kim Hòa Phát (Công ty Kim Hòa Phát)…
Cáo trạng của Viện KSND tối cao xác định, từ năm 2015, với tư cách Giám đốc, Chủ tịch Hội đồng mua sắm BV Tim Hà Nội, bị cáo Tuấn chủ trương cho một số doanh nghiệp được ký gửi vật tư để BV sử dụng trước, sau đó sẽ hợp thức cho các doanh nghiệp trúng thầu nhằm thanh toán. Do quen biết, các bị cáo Nguyễn Đức Đảng, Phan Tuấn Đạt đặt vấn đề và được bị cáo Tuấn đồng ý cho công ty của mình bán các mặt hàng vật tư tiêu hao can thiệp tim mạch vào BV Tim Hà Nội, với đơn giá theo thỏa thuận giữa 3 người.
Từ năm 2016 - 2017, BV Tim Hà Nội tổ chức 5 gói thầu mua sắm vật tư tiêu hao can thiệp tim mạch, tổng trị giá hơn 595 tỉ đồng. Trong đó, gói thầu số 5 năm 2016 tổ chức theo hình thức đấu thầu rộng rãi có trị giá trên 247 tỉ đồng, 4 gói thầu năm 2017 được áp dụng theo hình thức chỉ định thầu rút gọn trị giá gần 348 tỉ đồng. Để hợp thức hồ sơ thầu, bị cáo Tuấn cùng các cựu lãnh đạo, cán bộ BV đã có hành vi lợi dụng chức vụ, quyền hạn can thiệp trái pháp luật vào hoạt động đấu thầu. Nhóm này thông đồng với các bị cáo thuộc Công ty Hoàng Nga và Công ty Kim Hòa Phát thực hiện nhiều sai phạm từ khâu lập hồ sơ thầu, đơn giá, chủng loại, số lượng stent và các vật tư sẽ bán cho BV; đồng thời câu kết với công ty thẩm định giá để ban hành chứng thư thẩm định giá theo yêu cầu của BV, nhằm đảm bảo cho 2 công ty trúng thầu.
Kết quả không nằm ngoài dự tính, Công ty Hoàng Nga và Công ty Kim Hòa Phát trúng hàng loạt gói thầu cung cấp trang thiết bị y tế cho BV Tim Hà Nội, qua đó gây thiệt hại hơn 53,6 tỉ đồng, là số tiền chênh lệch giữa giá thiết bị y tế trúng thầu với giá thị trường.
Theo chỉ đạo của bị cáo Tuấn, BV Tim Hà Nội còn đề nghị các nhà thầu chi hỗ trợ cho BV từ 2 - 5% giá trị gói thầu; trong đó Công ty Hoàng Nga hằng năm hỗ trợ 300 triệu đồng, Công ty Kim Hòa Phát hằng năm hỗ trợ 60 triệu đồng; các khoản tiền này không được hạch toán vào sổ sách. Ngoài ra, bị cáo Tuấn khai nhận vào các dịp trước Tết âm lịch năm 2016 và 2017 được bị cáo Đảng biếu tổng số tiền 10.000 USD để "cảm ơn".
Trước khi phiên tòa mở, các bị cáo tự nguyện khắc phục tổng cộng hơn 21,3 tỉ đồng, riêng bị cáo Tuấn nộp 6,23 tỉ đồng. Cơ quan điều tra cũng kê biên 13 bất động sản, phong tỏa hơn 3 tỉ đồng cùng hàng chục ngàn USD trong tài khoản ngân hàng của một số bị cáo.