Chiều 19-5, Trung tâm Kiểm soát Bệnh tật TP.HCM (HCDC) cho biết kết quả giải trình tự gen của ca nhiễm COVID-19 ở TP Thủ Đức (BN4514) cho thấy bệnh nhân nhiễm virus SARS-CoV-2 thuộc biến chủng Ấn Độ B.1.617.2.
Theo thông tin báo cáo, nhóm nghiên cứu COVID-19 của Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới và Đơn vị Nghiên cứu lâm sàng Đại học Oxford, từ mẫu bệnh phẩm ngày 18-5 của BN4514 đã thu nhận được một bộ gene SARS-CoV-2 từ một mẫu RNA đưa vào phân tích.
Ca mắc COVID-19 ở TP Thủ Đức mang virus biến chủng B.1.617.2 của Ấn Độ. Ảnh xét nghiệm virus SARS-CoV-2 tại Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới TP.HCM. Ảnh: HOÀNG LAN
Kết quả định danh bằng phần mềm Pangolin cho thấy bộ gene thu được thuộc biến chủng B.1.617.2. Kết quả xác định đột biến bằng COV-GLUE cho thấy bộ gene mang 6 đột biến thay đổi aminoacid tiêu biểu (T19R, L452R, T478K, D614G, P681R, D950N) và một đột biến đứt đoạn (156-158) trên vùng protein gai của biến chủng B.1.617.2.
Qua đó, nhóm nghiên cứu kết luận BN4514 nhiễm SARS-CoV-2 biến chủng Ấn Độ B.1.617.2, cùng chủng đang lưu hành hiện nay tại các tỉnh phía Bắc Việt Nam.
Liên quan đến BN4514 còn có trường hợp nhiễm COVID-19 sống ở quận 7 đang được Bộ Y tế công bố. Hai người cùng làm việc chung trong một đội có 8 người tại một phòng làm việc trong công ty Grove, đường Pasteur, ở quận 3.
Bệnh nhân này đã rời khỏi TP.HCM từ ngày 24-4 đi Hải Phòng và trở về thành phố ngày 5-5 trên chuyến bay đi VN1179 từ Hải Phòng đến TP.HCM. Bệnh nhân có dấu hiệu sốt, tự mua thuốc uống vào ngày 8-5. Căn cứ vào kết quả dấu hiệu lâm sàng, yếu tố dịch tễ và xét nghiệm thì có nhiều chứng cứ cho thấy BN4514 bị lây từ bệnh nhân cư ngụ tại quận 7.
Tuy nhiên, do tình trạng bệnh nhân đang quá trình hồi phục nên rất khó để thực hiện giải trình tự gene. Nhóm nghiên cứu đang cố gắng để có thể giải trình tự bộ gen của SARS-CoV-2 trên bệnh nhân này.