Đánh giá hoạt động của mô hình Ban quản lý an toàn thực phẩm TP.HCM, các bộ, ngành trung ương đã đóng góp nhiều ý kiến trong việc lập đề án Sở An toàn thực phẩm. Hầu hết các bộ ngành đều đánh giá cao mô hình, hiệu quả, cách thức hoạt động của ban này. 

Trong đó Bộ Nội vụ cho rằng mô hình này được thí điểm để thực thi pháp luật trong công tác bảo đảm an toàn vệ sinh thực phẩm. Mô hình đã được đánh giá, tổng kết, khẳng định tính hiệu quả và cần thiết.

Thanh tra Chính phủ nhìn nhận việc thí điểm thành lập Ban quản lý an toàn thực phẩm TP.HCM đã cho nhiều kết quả tích cực trong quản lý nhà nước về an toàn thực phẩm. Việc có một cơ chế đặc thù cho TP về quản lý an toàn thực phẩm là cần thiết. 

Trên cơ sở đánh giá hiệu quả hoạt động của mô hình tổ chức Ban quản lý an toàn thực phẩm đang thí điểm ở một số tỉnh, thành, Bộ Y tế có trách nhiệm đề xuất sửa đổi Luật an toàn thực phẩm. Từ đó phân định rõ trách nhiệm tham mưu quản lý nhà nước đối với lĩnh vực này. Giúp việc hình thành mô hình tổ chức thực thi pháp luật về an toàn thực phẩm thống nhất toàn quốc.

Bộ Y tế cũng đưa ra đề xuất Chính phủ giao Bộ Nội vụ chủ trì, phối hợp với các đơn vị liên quan và UBND TP.HCM, Đà Nẵng, Bắc Ninh tổng kết, đánh giá tính hiệu quả của Ban quản lý an toàn thực phẩm và đề xuất giải pháp phù hợp.

Với những cơ sở nêu trên, UBND TP đề xuất được kéo dài thời gian thí điểm hoạt động của Ban quản lý an toàn thực phẩm TP.HCM. Thời gian kéo dài là từ ngày 1-4 cho đến khi Chính phủ quyết định mô hình hoạt động chính thức của ban này.