Trước đó, vào cuối tháng 7/2023, Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Khánh Hòa kết luận ông Nguyễn Vĩnh Thạnh với vai trò là Phó Chủ tịch UBND thị xã Ninh Hòa từ năm 2014-2019 và Chủ tịch UBND thị xã Ninh Hòa từ tháng 12/2019 đến tháng 12/2021 đã có sai phạm.
Cụ thể, ông Nguyễn Vĩnh Thạnh thiếu trách nhiệm trong việc kiểm tra, giám sát, đôn đốc các cơ quan chuyên môn thực hiện việc thu hồi, quản lý nhà, đất và yêu cầu người dân tháo dỡ công trình xây dựng trên đất để bàn giao cho Nhà nước quản lý.
Ông Thạnh không xin ý kiến UBND thị xã Ninh Hòa trước khi ký quyết định phê duyệt phương án bồi thường, tái định cư, trong đó bố trí 1 lô đất tái định cư không đúng quy định. Ông Nguyễn Vĩnh Thạnh bị Uỷ ban Kiểm tra Tỉnh ủy Khánh Hòa kỷ luật cảnh cáo.
Sau khi bị kỷ luật, ông Thạnh có đơn xin thôi chức Chủ tịch UBND thị xã, Phó Bí thư Thị ủy. Đơn của ông Thạnh đã được các cơ quan có thẩm quyền của tỉnh Khánh Hòa xem xét và Hội đồng Nhân dân thị xã Ninh Hòa đã tiến thành thủ tục miễn nhiệm. Hiện nay, ông Nguyễn Vĩnh Thạnh đang chờ phân công công tác khác. Việc điều hành Uỷ ban Nhân dân thị xã tạm thời do bà Nguyễn Thị Hồng Hải, Phó Chủ tịch Ủy ban Nhân dân thị xã đảm nhiệm.