Qua công tác nắm tình hình, cơ quan CSĐT Công an tỉnh Thanh Hóa phát hiện Lê Bá Nga đã trực tiếp thành lập, điều hành 2 công ty nhưng không hoạt động kinh doanh mà chỉ thực hiện việc mua hóa đơn, chứng từ khống để thu tiền bất chính.
Qua đó, từ đầu năm 2020 đến tháng 8/2022, Công ty TNHH Thanh Bình có trụ sở tại xã Đông Lĩnh, TP Thanh Hóa và công ty NDS Thanh Hóa, có trụ sở tại thị trấn Cảnh Nàng, huyện Bá Thước do Lê Bá Nga thành lập và điều hành đã xuất ra số hóa đơn lớn.
Mỗi hóa đơn Nga thu từ 5,5% đến 6% tổng giá trị hàng. Thực tế 2 Công ty này không có kinh doanh mà chỉ thực hiện bán hóa đơn, chứng từ khống thu lời bất chính.
Qua sao kê giao dịch tài khoản ngân hàng của 2 Công ty trên, cơ quan CSĐT Công an tỉnh Thanh Hóa xác định, tổng số tiền được lưu chuyển trong tài khoản (là số tiền hợp thức hóa việc thanh toán hợp đồng mua bán hàng hóa để xuất hóa đơn VAT theo quy định của pháp luật về mua bán, trao đổi hàng hóa ) gần 100 tỷ đồng.
Đây là số tiền hàng hóa được ghi trên hóa đơn giá trị gia tăng bán cho các công ty có nhu cầu mua hóa đơn đầu vào để kê khai, báo cáo với cơ quan thuế nhằm giảm số thuế phải nộp cho Nhà nước.
Từ kết quả điều tra xác minh, cơ quan CSĐT Công an tỉnh Thanh Hóa đã khám xét nơi ở của Lê Bá Nga thu giữ nhiều tài liệu liên quan đến mua bán hóa đơn GTGT, ra lệnh khởi tố, bắt tạm giam đối tượng để tiếp tục điều tra, mở rộng.