Trường có quy mô đào tạo khoảng 12.000 sinh viên. Năm học này trường tổ chức đào tạo 9 mã ngành đại học chính quy, 6 mã ngành liên thông và 67 mã ngành sau đại học.

Cũng theo PGS.TS Nguyễn Trung Kiên, năm học vừa qua trường có hơn 2.500 sinh viên tốt nghiệp, tỉ lệ đạt khá giỏi hơn 84%. Đây là lực lượng quan trọng bổ sung cho nguồn nhân lực y tế trong khu vực Đồng bằng sông Cửu Long.

Theo chiến lược trong giai đoạn 2021- 2025, Trường Đại học Y Dược Cần Thơ tiếp tục thực hiện đa dạng hoá các loại hình đào tạo, tăng cường chất lượng đào tạo và nhiều mô hình đào tạo mới đáp ứng nhu cầu xã hội. Đặc biệt, tiếp tục thực hiện lộ trình phát triển thành trường thành viên liên kết của mạng lưới các trường đại học hàng đầu Đông Nam Á.