Theo cáo trạng, Công ty CP Đầu tư phát triển nhà Đà Nẵng tiền thân là doanh nghiệp Nhà nước với tên gọi Công ty phát triển Nhà Đà Nẵng) do UBND TP Đà Nẵng nắm giữ 100% vốn chủ sở hữu (đến năm 2010 thì cổ phần hóa) đã có những sai phạm về quản lý, sử dụng tài sản gây thất thoát.
Lực lượng công an khám xét nơi làm việc của ông Nguyễn Quang Trung tại số 38 Nguyễn Chí Thanh, quận Hải Châu, Đà Nẵng..
Cụ thể, nhà đất tại 186 Trần Phú được UBND TP Đà Nẵng cấp 2 giấy chứng nhận quyền sử dụng đất số AN 104200 có diện tích 322,7m2 (đất cơ sở sản xuất kinh doanh) và số AN 104001 có diện tích 68,4m2 (đất ở đô thị) cho công ty này.
Quá trình mua, chuyển nhượng sử dụng thửa đất này được Tiên hạch toán và theo dõi trong danh mục tài sản cố định (thuộc doanh nghiệp Nhà nước). Mặc dù việc bán tài sản cố định thuộc doanh nghiệp Nhà nước phải tổ chức bán đấu giá, tổ chức thẩm định giá trước khi bán theo quy định nhưng Trung tự quyết định việc chuyển nhượng và giá chuyển nhượng nhà đất theo giấy chứng nhận số AN 104001, diện tích 68,4m2, diện tích sử dụng 255,4m2, tại 186 Trần Phú cho Công ty CP Địa ốc Phương Trang với giá gần 1,9 tỷ đồng, gây thất thoát cho Nhà nước.
Xí nghiệp công trình giao thông và xây dựng là đơn vị trực thuộc Công ty CP Đầu tư phát triển nhà Đà Nẵng. Ông Trung đã ký quyết định cấp tài sản là quyền sử dụng đất tại 31 Núi Thành (Đà Nẵng), diện tích 620m2 cho xí nghiệp công trình giao thông và xây dựng.
Quá trình kiểm kê tài sản để xác định giá trị doanh nghiệp cổ phần hóa đối với quyền sử dụng đất tại số 31 đường Núi Thành, mặc dù 2 giấy chứng nhận quyền sử dụng đất X 127544 và AB 143592 cấp cho 2 thửa đất diện tích 184,7m2 và 433,1m2 đã được hợp thửa và được thay thế bằng giấy chứng nhận số AC 148860 cho 1 thửa đất, diện tích 620m2 nhưng các bị can Trung, Duy, Uyển, Hà là thành viên của tổ giúp việc ban chỉ đạo cổ phần hóa và tổ kiểm kê tài sản có hành vi kiểm kê tài sản lập hồ sơ xác định giá trị doanh nghiệp cổ phần hóa không đúng quy định.
Cụ thể, các thành viên sử dụng bản sao 2 giấy chứng nhận quyền sử dụng đất X 127544 và AB 143592 để kê khai, xác định giá trị tài sản không đúng với thực tế 2 thửa đất đã được hợp thửa, làm giảm hệ số sinh lời của đất, giảm giá trị thửa đất khi xác định giá trị doanh nghiệp, gây thất thoát tài sản của Nhà nước.
Theo kết quả điều tra được công bố trong cáo trạng thì tổng số tiền bị thất thoát tại các nhà đất trên là hơn 2,6 tỷ đồng.